オープンソースで出回っている JavaScript コード（jQuery など）の中身を見ると、下記のように、無名関数を作って即実行という書き方をしてあります。

(function(window, undefined) {
  var foo = ...;
  var bar = ...;
  var PublicClass = {};
  PublicClass.prototype.hoge = function() {
  };
  ...
  window.PublicClass = PublicClass;
})(window);

これは、グローバルな名前空間を汚染するのを防ぐためです。 JavaScript には、ファイルスコープや、ブロックスコープがなく、関数スコープしかありません。 グローバルな名前空間に、必要のないオブジェクトを作成するのを防ぐためには、

• 全体を関数にして、関数スコープに閉じ込める。
• 公開するオブジェクトだけを、グローバルなプロパティとして見せる。

といった考慮が必要になってきます。