D-Bus メソッド経由でバイト配列を送ろうとして、パラメータのタイプを ay と定義して、gdbus-codegen でコード生成すると、デフォルトでは gchar* 型の文字列データとしてパラメータが定義されてしまいます。 gchar* データとしてやりとりしようとすると、0 を含むデータを受け取れなくなってしまうので、GVariant* としてバイナリデータを受け取る必要があります。 そのためには、Introspection XML の arg 要素の子要素として、以下のように annotation 要素を追加します。

introspection.xml（抜粋）

...
<method name="PushBinaryData">
    <arg type="ay" name="data" direction="in">
        <annotation name="org.gtk.GDBus.C.ForceGVariant" value="true" />
    </arg>
</method>
...

すると、GDBus サーバ側のハンドラでは GVariant* 型のパラメータとしてデータを受信できるようになるので、以下のように内部のデータを取得できます。 データのサイズも、GVariant オブジェクトから取得することができます。

// GVariant* variant;
const char* p = (const char*) g_variant_get_data(variant);
gsize size = g_variant_get_size(variant);

for (int i = 0; i < size; ++i) {
    g_print("data[%d]=%d\n", i, p[i]);
}